ПЦР анализ мутаций в гене CEBPA

Общая информация об исследовании

Данное исследование является генетическим тестом, который обнаруживает нарушения в гене CEBPA методом полимеразной цепной реакции.

Ген CEBPA расположен на длинном плече хромосомы 19 в положении 13.11 и руководит синтезом CСAAT (белок, связывающий энхансер – C/EBP-?). Этот белок связывается с конкретными областями ДНК, и его активность может изменять экспрессию генов, вовлеченных в регуляцию клеточного цикла. C/EBP-? участвует в дифференцировке (созревании) определенных клеток крови (например, гранулоцитов). Считается также, что он участвует в клеточных механизмах, которые помогают предотвратить неконтролируемые рост и деление клеток, а значит, и развитие онкологических процессов.

Установлено, что аномалии в гене CEBPA связаны с возникновением острого миелоидного лейкоза (острого миелолейкоза, ОМЛ) – это злокачественное заболевание крови, при котором неконтролируемо размножаются незрелые белые кровяные клетки, подавляя при этом рост нормальных клеток крови (эритроцитов, тромбоцитов и нормальных лейкоцитов). Острый миелолейкоз является вторым по распространённости типом острого лейкоза у взрослых.

По меньшей мере шесть мутаций в этом гене были идентифицированы в семьях с семейным острым миелоидным лейкозом с мутированным CEBPA, который является одним из типов ОМЛ. В результате появления аномалий в гене C/EBP-? нарушается его способность связывания с ДНК. Отсутствие функции супрессора опухолей C/EBP-? нарушает регуляцию образования клеток крови, что приводит к неконтролируемому производству аномальных клеток, которые возникают при остром миелоидном лейкозе.

Хотя мутации C/EBP-? отмечены по всей длине кодирующей области гена, значительно чаще повреждаются два фрагмента: N-терминальный и C-терминальный районы. N-терминальные мутации приводят к повреждению всего белка. Происходит трансактивация генов-мишеней и блок дифференцировки миелоидных клеток-предшественниц. При N-терминальных мутациях развиваются частично детерминированные миелоидные предшественники, которые и служат основой лейкозного клона клеток. С-терминальные мутации обычно расположены между основной кодирующей областью и последовательностью, кодирующей zipper-область. В результате мутации нарушается связывание ДНК поврежденным белком и C/EBP-? не может выполнять функцию супрессора опухолей. Большинство С-терминальных мутаций относится к гомозиготным. В таких ситуациях С-терминальные мутации приводят к повышенной пролиферации стволовых клеток и блокируют дифференцировку миелоидных клеток. Сочетание N- и С-терминальных мутаций обусловливает более быстрое развитие заболевания.

Предполагается, что мутации С/EBP-? происходят на ранних стадиях развития ОМЛ. Отмечено, что большинство пациентов с мутациями C/EBP-? имеют тот же тип мутации при рецидивах, что и во время первичной диагностики лейкоза.

Известно три различных варианта мутаций C/EBP-? у больных ОМЛ. Примерно у половины выявляется одиночная мутация в одном аллеле (single mutation, C/EBP?-sm), при этом сохраняется экспрессия гена дикого типа. Другая группа пациентов имеет двойную мутацию (double-mutated C/EBP?, C/EBP?-dm). В этих случаях белка дикого типа нет. Некоторые из таких пациентов имеют биаллельную мутацию с N-терминальной мутацией и сдвигом рамки считывания в одном аллеле и С-терминальную мутацию в пределах рамки считывания в другом. Гомозиготные мутации С/EBP? - это третий вариант аберрации. В таких случаях также нет белка дикого типа.

Изучение экспрессии генов у больных с различными мутациями С/EBP-? показало, что все они имеют похожую картину. Тем не менее было обнаружено, что пациенты с С-терминальной мутацией C/EBP?-sm меньше отличаются по профилю экспрессии генов от больных с C/EBP?-dm, чем пациенты с N-терминальной мутацией C/EBP?-sm. Кроме того, известно, что гомозиготные мутации С/EBP-? имеют аналогичную C/EBP?-dm экспрессию генов, что позволяет рассматривать эти мутации как равнозначные.

Известно, что "большие хромосомные аномалии" могут быть вовлечены в развитие острого миелоидного лейкоза, но около половины случаев не имеют таких аномалий – они классифицируются как ОМЛ с нормальным кариотипом (НК-ОМЛ). Мутации CEBPA встречаются примерно у 18 % людей с данной патологией. Более того, эти мутации не были обнаружены у пациентов с прогностически благоприятным кариотипом. Тем не менее отмечено сочетание делеции (потери) 9q и мутации C/EBP-?. Наличие сопутствующих генетических мутаций выявлено значительно реже у пациентов с C/EBP?-dm, чем с C/EBP?-sm. У пациентов с C/EBP?-dm практически не обнаруживаются мутации в FLT3 и NPM1.
Когда развитие ОМЛ связано с мутациями гена CEBPA, это состояние можно унаследовать, и в этом случае оно называется семейной острой миелоидной лейкемией с мутантным CEBPA (описанным выше), или не унаследовать (спорадический острый миелоидный лейкоз с мутированным CEBPA).

От 50 до 75 % всех лиц, имеющих ОМЛ с мутациями в гене CEBPA, как при спорадических (случайных), так и семейных формах, имеют два мутированных гена CEBPA в каждой клетке лейкемии. Остальные имеют только одну мутацию гена CEBPA. При спорадических случаях мутация появляется только в клетках лейкемии, а в семейных случаях она присутствует во всех клетках организма. Соматические мутации в других генах также могут способствовать развитию НК-ОМЛ.

Обнаружение двойной (биаллельной) мутации в гене CEBPA при нормальном кариотипе и отсутствии аномалий в гене FLT3-ITD ассоциируется с более благоприятным течением болезни и безрецидивной выживаемостью. Тогда как одиночная мутация CEBPA при НК-ОМЛ не является независимым прогностическим фактором.

Также рекомендуется

18-101 ПЦР-анализ мутаций в гене FLT3 (ITD, TKD)

Кто назначает исследование?

Онколог, гематолог.