FISH анализ перестроек 5 хромосомы

Общая информация об исследовании

Анализ с помощью флюоресцентной in situ гибридизации (fluorescence in situ hybridization, FISH) – молекулярно?цитогенетический метод для идентификации генетических аберраций (отклонений от нормы). Изначально данный метод использовался как исследовательский для выявления специфической ДНК-последовательности в хромосомах, но благодаря прогностической и предсказательной ценности был внедрен в клиническую практику.

Метод основан на использовании флуоресцентно-меченых ДНК-зондов, которые представляют собой искусственно синтезированные фрагменты ДНК (олигонуклеотиды), последовательность которых комплементарна последовательности ДНК исследуемых аберрантных хромосом. ДНК-зонды различаются по специфичности – для каждой хромосомной аномалии используются свои ДНК-зонды. Также зонды различаются по размеру: одни могут быть направлены к целой хромосоме, другие – к конкретному локусу (фрагменту хромосомы или гена).

После специальной процедуры – денатурации молекула ДНК приобретает вид одноцепочечной нити. ДНК-зонд гибридизуется (связывается) с комплементарной ему нуклеотидной последовательностью и может быть обнаружен при помощи флуоресцентного микроскопа. Данное состояние интерпретируется как положительный результат FISH-теста. При отсутствии аберрантных хромосом несвязанные ДНК-зонды в ходе реакции "отмываются", что при исследовании с помощью флуоресцентного микроскопа определяется как отсутствие флуоресцентного сигнала (отрицательный результат FISH-теста). Метод позволяет оценить не только наличие флуоресцентного сигнала, но и его интенсивность и локализацию. Таким образом, FISH-тест – это еще и количественный метод.

FISH имеет широкие возможности в клинической онкологии для обнаружения хромосомных аномалий в опухолевых клетках. Исследование определяет генетический состав клетки как во время митоза, так и в интерфазе. FISH имеет высокую чувствительность – позволяет обнаружить индивидуальные гены, кроме того, в одном препарате может быть использовано несколько зондов с различными красителями.

FISH-анализ широко применяется при лимфопролиферативных заболеваниях, являясь в ряде случаев определяющим фактором для подтверждения диагноза.

Миелодиспластический синдром (МДС) представляет собой гетерогенную группу миелоидных заболеваний, характеризующихся дефектом костномозгового кроветворения, которые вызывают периферические цитопении, рецидивирующие цитогенетические нарушения и переменный риск прогрессирования в острый миелоидный лейкоз (ОМЛ). Делеция хромосомы 5q – одна из распространенных генетических аномалий, выявляемых при миелоидных новообразованиях, особенно при миелодиспластическом синдроме и остром миелоидном лейкозе. Основываясь на исследованиях, проведенных в основном на пациентах с миелодиспластическим синдромом, сообщалось, что две часто удаляемые области в 5q31 и 5q33 минимально необходимы для фенотипа; обе часто удаляемые области были удалены у большинства пациентов с миелодиспластическим синдромом с del (5q). В то время как делеции 5q при миелодиспластическом синдроме часто сопровождаются дополнительными цитогенетическими нарушениями или даже сложным кариотипом, миелодиспластический синдром с изолированным del (5q) является хорошо узнаваемым заболеванием, которое демонстрирует относительно благоприятный прогноз и характерные признаки, такие как макроцитарная анемия, различная степень тромбоцитоза и наличие гиполобированных мегакариоцитов. Было показано, что гены, часто удаляемые в области 5q (RPS14 и mir145), играют важную роль в патогенезе миелодиспластического синдрома с del(5q).

Кто назначает исследование?

Гематолог, онколог.

Также рекомендуется

• [02-043] Клинический анализ крови: общий анализ, лейкоцитарная формула, СОЭ (с обязательной микроскопией мазка крови)
• [02-027] Ретикулоциты
• [16-012] Цитогенетический анализ клеток костного мозга (кариотип)
• [18-113] FISH-анализ делеции 12p
• [18-114] FISH-анализ делеций 20q
• [18-117] FISH анализ перестроек 3q
• [18-119] FISH-анализ перестроек 7-й хромосомы
• [18-123] FISH-анализ перестроек MLL-гена

Литература

• Islam M, Mohamed Z, Assenov Y. Differential Analysis of Genetic, Epigenetic, and Cytogenetic Abnormalities in AML. Int J Genomics. 2017;2017:2913648.
• Johnston RD, Sayedian FH, Mendiola C. Is 5q deletion in de novo Acute Myelogenous Leukemia (AML) with excess blasts a surrogate marker for the cryptic t(7;21)(p22;q22)? A case report and review of literature. Cancer Genet. 2022 Apr;262-263:30-34.
• Rea B, Aggarwal N, Yatsenko SA. Acute myeloid leukemia with isolated del(5q) is associated with IDH1/IDH2 mutations and better prognosis when compared to acute myeloid leukemia with complex karyotype including del(5q). Mod Pathol. 2020 Apr;33(4):566-575.